很久很久以前，如今北侖區穿山半島的南部沿海灘涂中星羅棋布地環列著九叢荒山島嶼。這些島嶼與北部大陸(今白峰鎮)的太白山余脈相連，涂灘相通。千萬年來，由于火山活動、地震、海嘯、風暴等自然災害的影響，逐漸被海潮沖蝕成橫貫東西的梅山江和縱橫南北的三江浦。從此，九叢荒山島嶼與大陸分離。當時荒島中沒有定居的先民，古木參天，禽獸出沒，也沒有島名。根據宋代《寶慶志》上記載稱本地區：“鹽鹵之地濱海孤絕處”。

　　明代洪武十六年(公元1387年)，朝廷派遣信國公兼沿海制置使湯和設置郭巨所、大嵩巡檢司(原梅山村)后，明官兵在這里設置炮臺、烽火臺(原炮臺村)，抗御倭寇。當時山澗中梅樹叢生。隆冬時節，梅花盛開，芳香飄谷；初夏時節，梅子壓枝，令人饞涎欲滴。澗下有水坑，平時溪水汩汩、清涼甘甜。沿海軍民經常在梅樹坑中(今炮臺崗下附近)汲取溪水。從此梅樹坑、梅子山因此得名。

　　到了清代康熙年間，原梅山村李氏祖先從郭巨所石鼓弄遷居梅子山定居，并于乾隆年間在這里(今廟灣畈)建梅子山廟，神祀“漢室孤忠”梅福。后來經過二百余年的生息繁衍，在人口驟增的同時，耕地也成倍增加。到了道光年間，居民就以梅山命村名。后來從柴橋遷居炮臺下的李氏也以炮臺名村名；居住盤峙岙的賀氏、朱氏、李氏等居民以盤峙命村名；居住洪家山一帶的洪氏、賀氏等居民以碑塔命村名。直到道光壬年(公元1830年)前，當時四個村都定居在梅山島東部的一個小島上，同定居梅西地區七個村的霞岸島間隔一條三江浦。東西兩島居民如果走親訪友或貿易往來，必須乘坐竹筏或木桶當作渡江工具進行往返。

　　清代道光壬辰年秋(公元1830年)，東西兩島居民在三江浦南北兩端筑八百畝塘，從此兩島合一，行政隸屬鎮海縣三都一圖(原郭巨鎮)。

　　經過三百多年的伐薪燒荒、造田墾植，梅子山附近山坡澗谷中的梅樹已被砍盡伐絕，但是，梅樹那種素影橫斜的婀娜枝條、沁人肺腑的芳香和凌寒獨放的品格，卻令人永志難忘。

　　到了民國五年(公元1915年)，全國實行了鄉(鎮)村建制后，本島以村命鄉名，于是稱梅山鄉，隸屬柴橋鎮。公元1953年-1986年后隸屬郭巨區，公元1987年-2007年隸屬北侖。

　　2008年2月24日，國務院正式批準設立寧波梅山保稅港區。這是繼上海洋山、天津東疆、大連大窯灣、海南洋浦之后的中國第5個保稅港區。